A Sanepar atua em conjunto com os órgãos da defesa civil, desde o ano de 2004, em ações de identificação, prevenção, preparação e resposta a situações de emergências ambientais que possam afetar a qualidade da água dos mananciais que são utilizados pela SANEPAR para abastecimento público.

Dentre as diversas ações que a Sanepar atua está a participação na Comissão Estadual de Prevenção, Preparação e Resposta a Emergências Ambientais com Produtos Químicos Perigosos - CEP2R2 e seus Grupos Técnicos (Rodoviário, Ferroviário, Empresas e Insumos Agrícolas)

Como preparação a SANEPAR desenvolve ações de georreferenciamento e geoprocessamento identificando as áreas que podem trazer riscos ambientais para os mananciais, como rodovias e ferrovias que cruzam bacias de mananciais. 

Como preparação e resposta a SANEPAR mantém relacionamento estreito com os diversos órgãos componentes da Defesa Civil (bombeiros, IAT, polícias rodoviárias, entre outros) através do Plantão de Emergências Ambientais, com o objetivo de manter uma sistemática de comunicação de acidentes ambientais ágil, eficiente e eficaz visando garantir que cada incidente seja reportado e tenha a resposta adequada sempre visando garantir a segurança e a qualidade da água produzida e distribuída pela Sanepar.